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外显子组测序

产品简介

外显子组测序是一种针对基因组中蛋白质编码区域(外显子)及部分调控区域(如UTR)的靶向测序技术。通过高通量测序平台(如Illumina、Ion Torrent、PacBio)对全基因组外显子区域(占人类基因组约1%)进行深度测序,可高效检测单核苷酸变异(SNV)、插入缺失(InDel)、拷贝数变异(CNV)等,是研究疾病相关遗传变异的核心工具。

技术优势

(1)高效经济

靶向测序:仅覆盖外显子区域(约30 Mb),相比全基因组测序(WGS)节省70%成本和时间。

高深度覆盖:测序深度可达80×~150×,显著提高低频突变(<1%)和罕见突变的检出率。

数据解读简便:聚焦编码区,减少非编码区噪声干扰,降低分析复杂度。

(2)精准诊断

致病突变富集:85%以上的人类致病突变集中在外显子区(如《中国儿童PAH遗传研究》揭示的BMPR2突变)。

多疾病覆盖:适用于单基因病、复杂疾病(如癌症、代谢病)、肿瘤分子分型等。



技术路线

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应用领域

1、临床医学

(1)遗传病诊断

案例:小宇确诊为肝豆状核变性(ATP7B基因突变),通过WES明确病因并指导铜螯合剂治疗(《基因放大镜》案例)。

应用:单基因病:如先天性耳聋(GJB2)、囊性纤维化(CFTR)、DMD。

复杂疾病:如帕金森病(LRRK2)、糖尿病(TCF7L2)。

产前诊断:无创胎儿染色体异常筛查。

(2)肿瘤研究

案例:结直肠癌研究中发现原发灶与转移灶的异质性(Annals of Oncology 2017)。

应用:体细胞突变检测:识别驱动基因(TP53、EGFR)、融合基因(EWSR1-BEND2)。

治疗指导:匹配靶向药物(BRAF抑制剂)、免疫治疗标志物(MSI、HRD)。

CUP(原发灶不明肿瘤):通过WES+算法溯源(CUPPA)。

(3)感染性疾病

案例:SARS-CoV-2突变监测(如Delta/B.1.617.2变异株)。

应用:病毒进化分析、耐药菌株溯源(如MRSA)。

2、科研领域

(1)遗传机制研究

案例:中国儿童肺动脉高压(PAH)遗传特征解析(BMPR2突变占27.8%)。

应用:解析疾病易感基因(如FTO与肥胖)、药物代谢基因(CYP2C19与氯吡格雷疗效)。

(2)进化与群体遗传

案例:古DNA研究揭示尼安德特人与现代人的基因交流。

应用:物种进化树构建、种群迁移分析。

3、农业与育种

(1)作物改良

案例:番茄SUN基因调控果实形态,指导高产育种(Nature 2025)。

应用:抗病(水稻稻瘟病抗性基因Pi-ta)、抗逆(玉米耐旱基因ZmNAC111)。

(2)经济动物研究

案例:猪脂肪沉积相关基因FABP4的表达调控(J Anim Sci 2024)。

应用:提升肉质、产奶量等经济性状。

4、其他领域

(1)法医学

案例:2025年,WES在亲子鉴定中实现99.99%准确率(妙手医生)。

应用:失踪人口识别、刑事案件DNA比对。

(2)个性化医疗

案例:Geno4ME研究预测华法林剂量(CYP2C9/ VKORC1基因多态性)。

应用:避免药物不良反应(如卡马西平引发的史蒂文斯-约翰逊综合征)。