空间代谢组学(Spatial Metabolomics)是一种结合质谱成像技术与代谢组学分析的前沿技术,专注于在细胞、组织、器官等生物样本的空间环境中检测和解析代谢物、脂质、药物及其他小分子的分布与功能。通过基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI-MSI)、解吸电喷雾电离质谱成像(DESI-MSI)等技术,实现代谢物的定性、定量与空间定位,突破了传统代谢组学仅能提供“总量”信息的局限,为研究生物体的代谢异质性、疾病机制及药物作用提供了全新的视角 。
高空间分辨率:最高可达 5 μm,甚至亚细胞器级(如线粒体、突触)。
无标记检测:无需荧光标记或抗体,直接检测内源性代谢物(如氨基酸、脂质、核苷类)。
高覆盖度:覆盖 2000+种代谢物,包括胆碱类、多胺类、脂质类、碳水化合物类等。
临床转化潜力:直接分析FFPE或新鲜组织样本,支持疾病分型、药物靶点筛选及精准医疗。
多组学整合:与空间转录组学、蛋白质组学结合,揭示代谢-基因-蛋白协同调控网络。
1、肿瘤研究与精准医疗
案例1:前列腺癌诊断技术:空间代谢组学 + 脂质组学
成果:发现 NCE、基质、癌组织 的代谢物差异(如柠檬酸盐、肉碱、N-乙酰天冬氨酸)(JCO, 2025)。
案例2:肝癌分型技术:MALDI-MSI + 机器学习
成果:识别 甘油磷酰乙醇胺、脱氢表雄酮 作为分子分型标志物(J Hepatol, 2025)。
2、药物研发与毒性评估
案例1:肾毒性药物机制技术:AFADESI-MSI
成果:解析马兜铃酸I诱导的 精氨酸-肌酸酐代谢途径 异常(PNAS, 2019)。
案例2:二甲双胍疗效技术:MALDI-MSI
成果:发现糖尿病肾病中 NADH、p-cresol sulfate 的区域特异性变化(Life Metabolism, 2025)。
3、神经科学与疾病机制
案例1:阿尔茨海默病技术:DESI-MSI + AI建模
成果:揭示 β-淀粉样蛋白沉积 与硫代谢紊乱的关联(Nature Neuroscience, 2024)。
案例2:脑缺血技术:空间代谢组学 + 血管成像
成果:解析缺血区域 腺苷、乳酸 的代谢重编程(Stroke, 2025)。
4、农业与植物科学
案例1:作物抗逆性技术:空间代谢组学 + 转录组学
成果:解析盐胁迫下 脯氨酸、甜菜碱 的空间分布(Plant Cell, 2025)。
案例2:药用植物成分定位技术:MALDI-MSI
成果:发现甘草中 甘草酸 在根部的特异性积累(Phytochemistry, 2024)。
5、感染与炎症研究
案例1:病毒-宿主互作技术:空间代谢组学 + 单细胞测序
成果:揭示新冠病毒感染后 线粒体代谢 的异常(Cell Host & Microbe, 2025)。
案例2:肠道炎症技术:DESI-MSI
成果:发现 短链脂肪酸 在结肠炎区域的分布特征(Gut, 2024)。