科研服务
SCIENTIFIC
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miRNA测序（microRNA sequencing）是一种基于高通量测序技术的非编码小RNA（18-30 nt）分析手段，能够全面鉴定样本中已知和未知的miRNA，并解析其表达水平、靶基因调控网络及生物学功能。miRNA通过结合靶mRNA的3'UTR区域，在转录后水平调控基因表达，与癌症、心血管疾病、免疫疾病等多种病理过程密切相关。miRNA测序技术突破了传统方法（如qPCR、芯片）的局限性，支持无偏检测和新miRNA发现，已成为生命科学研究的核心工具。
高通量与高灵敏度：一次测序可获得数百万条reads，检测低至单拷贝水平的miRNA。
分辨率高：可区分单碱基差异的miRNA异构体（如miR-21-5p vs miR-21-3p）。
无需依赖已知信息：既可鉴定已知miRNA（比对miRBase数据库），也可预测新miRNA（基于二级结构和表达特征）。
多组学整合：支持与转录组、蛋白组、表观组联合分析，解析miRNA-靶基因调控网络。
样本起始量低：支持总RNA起始量低至1 ng（如QIAseq miRNA Library Kit）。
数据质量高：Q30≥85%（Illumina平台），Q20＞90%（Oxford Nanopore）。
分析深度广：覆盖miRNA表达谱、靶基因预测、通路富集、SNP分析、非编码RNA（sRNA/piRNA）鉴定等。
定制化服务：提供从样本提取到数据分析的全流程解决方案，支持外泌体miRNA、组织/血清/血浆miRNA等特殊样本类型。
1、医学与临床研究
（1）疾病诊断与标志物开发
案例：GASTROClear™胃癌早筛试剂盒，技术：血液miRNA检测
成果：对Ⅰ期胃癌灵敏度达87.5%，对<1 cm早期病变检出率达75%。
应用：癌症早筛：识别血液/体液中异常表达的miRNA（如miR-342-3p与心脏修复相关）。
无创检测：外泌体miRNA作为肿瘤标志物（如子宫内膜癌中的miR-106b-5p）。
（2）治疗靶点与药物开发
案例：miR-7/TGF-β2轴调控肺癌转移（Acta Pharm Sin B, 2022）技术：miRNA-seq + 蛋白质组学
成果：发现miR-7-5p下调促进TGF-β2表达，加速肺癌转移。
应用：靶向治疗：设计miRNA mimic/inhibitor调控关键通路（如MAPK/ERK通路）。
药物筛选：基于miRNA表达谱筛选小分子药物（如抑制剂或激动剂）。
2、农业与生物技术
（1）作物抗逆性研究
案例：植物miRNA调控干旱胁迫响应（Scientific Reports, 2021）技术：miRNA-seq + mRNA-seq联合分析
成果：揭示miR-160靶向ARF基因调控根系发育。
应用：抗逆育种：筛选耐盐碱、抗旱作物品种。
基因编辑：通过CRISPR/Cas9调控关键miRNA表达。
（2）畜禽养殖优化
案例：猪生长性状相关miRNA挖掘（The Plant Cell, 2019）技术：组织miRNA测序
成果：鉴定miR-21调控脂肪沉积的关键作用。
应用：性状改良：提升肉质、产奶量等经济性状。
疾病防控：解析病原体感染相关的miRNA响应机制。
3、基础科学研究
（1）生长发育调控
案例：miRNA调控果蝇发育（Developmental Biology, 2020）技术：胚胎miRNA测序
成果：发现miR-14调控细胞凋亡与器官形成。
应用：模式生物研究：解析miRNA在胚胎发育、性别决定中的作用。
进化分析：比较不同物种miRNA保守性（如哺乳动物vs昆虫）。
（2）非编码RNA功能
案例：piRNA参与生殖细胞分化（Nature Communications, 2021）技术：小RNA测序
成果：鉴定piRNA靶向逆转录病毒元件维持基因组稳定性。
应用：基因沉默机制：研究siRNA、piRNA等非编码RNA的调控网络。
表观遗传学：解析miRNA介导的DNA甲基化、组蛋白修饰。
4、工业与环境研究
（1）工业微生物优化
案例：乳酸菌发酵过程中miRNA调控代谢（Lactobacillus bulgaricus）技术：发酵液miRNA测序
成果：发现miR-23b调控乳酸合成通路。
应用：产酶能力提升：优化碳源利用效率（如淀粉降解酶）。
菌株改造：定向敲除/过表达关键miRNA。
（2）环境微生物研究
案例：深海微生物降解有机质的miRNA调控（Microbiome, 2024）技术：宏转录组+miRNA测序
成果：揭示miR-124靶向脂肪酸氧化酶。
应用：生物修复：筛选污染物降解菌株的miRNA响应机制。
极端环境适应：解析嗜热、嗜盐微生物的miRNA调控网络。