• 高灵敏度：可检测单个细胞中1000+蛋白质，10个细胞中~2000个蛋白质，100个细胞中4000+蛋白质。

• 单细胞分辨率：精准解析细胞异质性，识别稀有细胞亚群（如肿瘤干细胞、耐药细胞）。

• 多组学整合：支持与单细胞转录组、表观组、代谢组联合分析，构建“基因-蛋白-功能”调控网络。

•  空间信息整合：结合空间单细胞蛋白组技术（如PCF技术），实现组织微环境的空间定位与互作分析。

•  全流程自动化：采用压电声学分配技术（如cellenONE平台），单细胞分选率高达98%，细胞存活率>85%。

•  高重复性：三次重复实验的蛋白质鉴定重合度~70%，皮尔森相关系数R值达0.935。

•  低样本起始量：支持50个细胞起始的单细胞分选（传统FACS需2万细胞）。

•  多参数共检：单次实验最多可检测100+蛋白标记物（空间单细胞技术），解析复杂生物学网络。

案例：小鼠类原肠胚发育中的单细胞蛋白组图谱（Cell Stem Cell, 2024）技术：SCP + 单细胞转录组。 

成果：发现中胚层细胞存在三个亚群，揭示胚胎发育的分子机制。 

应用：肿瘤亚群鉴定：识别干性细胞、迁移潜能细胞及耐药亚群（如乳腺癌CD44+细胞）。 

转移预测：通过蛋白表达谱预测肿瘤转移风险（如E-cadherin低表达提示侵袭性）。

案例：前列腺癌耐药机制研究（Advanced Science, 2024）技术：SCP + 单细胞翻译组。 

成果：发现YTHDF3蛋白表达下降导致老龄卵母细胞减数分裂受阻。

应用：耐药亚群筛选：识别药物干预后存活的耐药细胞（如化疗后P-gp高表达细胞）。

联合用药策略：基于蛋白通路激活状态设计靶向组合（如PI3K/AKT抑制剂+MEK抑制剂）。

案例：肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）功能解析，技术：SCP + 空间蛋白组。 

成果：揭示TIL的空间分布与肿瘤微环境互作机制。

应用：免疫细胞分型：区分耗竭T细胞（PD-1+ TIM-3+）与记忆T细胞（CD62L+）。

CAR-T优化：通过蛋白表达谱筛选高活性CAR-T细胞亚群。

案例：植物茉莉酸（JA）响应中的蛋白调控（Plant Physiology, 2023）技术：SCP + 转录组联合分析。

成果：发现JA信号通路中关键蛋白激酶的单细胞表达差异。

应用：抗逆育种：筛选耐盐碱、抗旱作物的蛋白标记（如HSP70、LEA蛋白）。

基因编辑验证：通过SCP验证CRISPR靶基因的蛋白水平功能。

案例：藏羊繁殖力相关蛋白挖掘（青海省科技厅项目）技术：SCP + 转录组联合分析。 

成果：鉴定FecB基因调控的蛋白网络，揭示多羔性状机制。

应用：经济性状优化：提升肉质、产奶量（如MSTN蛋白抑制）。

疾病防控：解析病原体感染中的宿主蛋白响应（如PRRSV感染中的IFN-γ信号）。

案例：小鼠卵母细胞衰老机制（Advanced Science, 2024）技术：SCP + 单细胞翻译组。 

成果：发现m6A读取蛋白YTHDF3调控卵母细胞减数分裂。

应用：发育轨迹重建：解析胚胎干细胞分化为三胚层的蛋白动态（如SOX2→NEUROG2）。

再生医学：鉴定诱导多能干细胞（iPSCs）重编程的关键蛋白（如OCT4、NANOG）。

案例：m6A修饰对蛋白翻译的影响，技术：SCP + 单细胞翻译组。 

成果：揭示m6A修饰通过YTHDF3调控蛋白合成效率。

应用：翻译动态解析：研究mRNA修饰（如m6A、m5C）对蛋白翻译的影响。

菌株改造：定向敲除/过表达关键Small RNA非编码RNA功能：解析lncRNA与翻译起始因子的互作机制。

案例：乳酸菌发酵代谢调控（Lactobacillus bulgaricus）技术：SCP + 代谢组联合分析。 

成果：发现乳酸脱氢酶（LDH）的单细胞表达差异影响产酸效率。

应用：产酶能力提升：优化淀粉降解酶（如α-淀粉酶）的表达。

菌株改造：定向敲除/过表达关键蛋白（如耐高温蛋白酶）。

案例：深海微生物降解有机质的蛋白调控（Microbiome, 2024）技术：SCP + 宏蛋白组联合分析。 

成果：揭示脂肪酸氧化酶（ACOX）的单细胞活性差异。

应用：生物修复：筛选污染物降解菌株的蛋白响应机制（如石油降解酶）。

极端环境适应：解析嗜热、嗜盐微生物的蛋白稳定性机制。