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空间转录组

产品简介

空间转录组学(Spatial Transcriptomics)是一项革命性的高通量测序技术,能够在保留组织空间位置信息的前提下,全面解析基因表达图谱。与传统转录组技术相比,该技术不仅揭示了“哪些基因在表达”,更明确了“这些基因在哪里表达”,为理解组织微环境、细胞异质性和疾病机制提供了全新的研究维度。我们的空间转录组产品基于国际领先的平台(如10x Genomics Visium、10x Genomics Xenium等),结合自主研发的技术优化和生物信息分析流程,可广泛应用于肿瘤生物学、神经科学、发育生物学、免疫微环境、植物生物学等多个研究领域。

技术优势

  • 样本兼容性广泛:10x Visium HD现在支持FFPE(福尔马林固定石蜡包埋)、新鲜冷冻(FF)及新鲜固定(FxF)样本类型,极大地扩展了可检测样本的范围。这一进步使得研究人员能够利用长期保存的样本进行研究,为回顾性分析和临床样本的应用提供了可能。

  • 单细胞水平的空间解析度:10x Visium HD系统将原有的55 μm spot分辨率提升至2x2 μm正方形spots,实现了真正的单细胞水平的空间组织结构分析。这使得在组织切片上精确地定位和量化基因表达成为现实,极大地增强了对复杂组织结构的理解。

  • 精准肿瘤微环境分析:通过精细映射细胞类型在肿瘤微环境中的空间分布,10x Visium HD技术帮助研究人员更好地理解细胞间的相互作用及其对肿瘤发展的潜在影响。这对于探索癌症生物学机制、开发新的治疗策略具有重要意义。

  •  亚细胞级别的详细洞察:10x Xenium技术采用挂锁式探针结合多轮荧光检测技术,能够实现单细胞乃至亚细胞级别的分辨率。这种能力使研究人员能够在复杂的组织环境中精确定位并识别基因表达模式,对于深入研究细胞交互作用和疾病机制至关重要。

  •  灵活定制化解决方案:10x Xenium提供针对人和小鼠成熟的5000个基因panel,并支持多种组织类型的分析。此外,它还允许用户自定义最多480个靶点的基因组合,以满足从基础科学研究到临床应用的不同需求,为个性化医疗和精准治疗开辟了新途径。

  •  高效的大面积组织分析:10x Xenium载玻片成像区域尺寸达到10.5 mm x 22.5 mm,且一次实验可同时处理两张玻片,非常适合于需要大面积组织横截面的研究项目。这不仅提高了检测效率,也扩大了单次实验的数据产出规模。

技术路线

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应用领域

1、肿瘤微环境解析
识别肿瘤边界、浸润免疫细胞分布、转移相关区域的基因特征。
2、神经系统疾病研究

绘制脑区特异性基因表达图谱,探索神经退行性疾病的分子机制。

3、临床病理关联分析

结合HE染色图像与基因表达数据,辅助精准诊断与分型。

4、植物空间发育研究

解析器官发育过程中基因的空间表达模式,助力功能基因挖掘。

5、药物靶点定位

识别药物作用靶区及响应区域,指导个性化治疗策略制定。